Klementinum se nachází na pravém břehu Vltavy na Starém Městě pražském, přímo proti Karlovu mostu a jeho Staroměstské mostecké věži. Kostel svatého Klimenta představuje jeden z jejich čtyř kostelů. Pokud půjdete od Karlova mostu, dále Karlovou ulicí, potom, Klementinum bude po Vaší levé ruce a asi po 100 metrech chůze uvidíte bílý barokní vstup do kostela svatého Klimenta.
Do kostela můžete rovněž přijí od Staroměstského náměstí nebo Staroměstské stanice metra a to tak, že přijdete z Mariánského náměstí (východní vstup), projdete Klementinem, vyjdete do Karlovy ulice a potom kostel sv. Klimenta bude hned po Vaší pravé ruce. Kromě metra můžete přjet rovněž tramvajemi 2, 17 nebo 18, rovněž do stanice Staroměstská. Ke kostelu můžete rovněž přijít Křižovnickou ulicí a pak doleva.
